Gene |
Name |
Pav_sc0000716.1_g520.1.mk |
Chromosome |
Name |
PAV_r1.0chr3 |
Start |
5302962 |
End |
5305442 |
PAV_r1.0 |
Name |
Pav_sc0000716.1 |
Start |
343713 |
End |
346193 |
Direction |
- |
Annotation |
NR |
PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At1g15510, chloroplastic |
Sequence |
CDS |
ATGACAGTCTGCAGCACTTCCTCTATCTCCACACAGAACCCAAACTCCGATTTGAACGAG
CTTTGCCGCCATGGGAACCTTGAAAAAGCTCTGAAGCTCTTGGATTCAATGCAGGAGCTT
CAAATTAAAGTGGAAGAAGATGCTTATATTGCTTTGGTTAGGCTGTGTGAGTGGAAGAGA
ACACACGAGGAAGGAGCTCGTGTGTACTCTTATGTATCGAATTCCACGACCCTTTTGAGT
GTTAAGCTTGGTAATGCCTTGTTGAGCATGTTTGTGAGGTTTGGTAATTTGGTTGATGCT
TGGTATGTGTTTGGAAGAATGGGGGAGAGGGACGTGTTTTCTTGGAATGTTTTGGTTGGT
GGGTATGCGAAAGCTGGGTTCTTTGATGAGGCTTTGAATTTGTATCACAGAATGTTGTGG
GTTGGGATTGTGCCTGATGTGTATACATTTCCTTGTGTTCTTAGGACTTGTGGGGCCGTC
CCGGACTTGGCGAGGGGAAGGGAGATTCATGTACACGTGATTAGATTTGGGTTTGAGTCG
GATGTTGATGTGGTTAATGCTTTGATTACAATGTATGTAAAATGTAGTGCCGTTGGCAGT
GCACGGATGTTGTTTGATAGAATGCCTAGGAGGGATAGGATCTCGTGGAATGCTATGATT
TCGGGGTATTTTGAAAATGGAGAGTTTTTGGAAGGATTGAGATTGTTTCTCATGATGCTT
GAATCTTCAGTTTATCCGGATTTGATGACTATGACTAGCTTGATATCTGCTTGTGAGCTT
CTTGGTGACTGTGAGTTAGGGAGGGAAATCCATGGTTTTGTCATGAGAACAGAGTTTGCG
GAGGATGTTTCAGTGTGTAATGCTTTAATTCAGATGTATTCAATCATTGGGCATTTTGAG
GAAGCAGAAAAAGTTTTTTCTAGAATGGAATATAAAGATGTGGTGTCATGGACATCGATG
ATTTCGTGTTATGGTAATAATGCACTGCCTGACAAGGCTGTGGAAACCTACAGAATGATG
GAGCGAGAGGGTATCATGCCAGATGAAATAACCATAGCCAGTGTTCTATCTGCTTGTGCT
TGTTTAGGGAATTTAGATATGGGTGTGAAGCTTCATGAGCTTGCTTACAGAACTGGGTTC
ATATCATATGTGATAGTTGCCAATACGCTCATTGATATGTATTCTAAATGTAAATGCGTT
GATAAGGCTTTGGAAGTGTTCCATGGCATCCCAGGAAAGAATGTCATATCTTGGACTTCA
ATCATACTTGGCCTTCGGATCAACAATCGGTGCTTTGAGGCTTTGATTTTCTTTCGGCAA
ATGAAACTCAGTCTAAAACCAAATTCTGTTACCTTGGTTTCTGTCCTGTCTGCTTGTGCT
AGAATAGGAGCTTTGATGTGTGGAAAGGAAATTCATGCCCATGCATTAAGGACTGGTGTA
GCATTTGATGGTTATTTACCTAATGCGCTTCTAGACATGTATGTAAGGTGTGGAAGGATG
GGATCTGCATGGAACCAGTTTAACTATAACAAAAAGGATGTTGCAGCATGGAATATCCTT
CTAACTGGCTATGCACAGAGGGGGCAAGGAAGGCATGCTGTTGAGCTATTTGACCGTATG
GTTGAGTCCCATGCAGATCCAGATGAGATCACATTTATTTCATTGTTATGTGCTTGTAGT
AGGTCTGGCATGGTTGGAGAAGGTTTGGAGTATTTTAGAAGCATGAAACTTAATTATTCC
ATCACACCTAATCTCAAGCACTATGCTTGCGTTGTTGATCTACTTGGTTGTGCTGGGCAA
TTGGATGATGCTCACGAGTTTATACAGAAGATGCCTATAAATCCAGATCCAGCTATATGG
GGAGCTTTGTTGAATGCATGCATGATCCACAAGCAGGTTGAGCTTGGTGAACTTGCAGCT
CATCAAATTTTAAAAATGGATACAGAAAGTGTTGGGTATTATGCACTTATCTGTAATCTC
TATGCTCAATGCGGTAAGTGGGAAGAAGTTGCAATAGTAAGAAAGACGATGAGGAAAAGG
GGCCTGACTGTAGATCCTGGGTGCAGTTGGGTGGAAGTAAAGGGAAAGGTTCATGCTTTC
CTAAGTGGTGATAATTTCCACCCTCAAATAAAGGAACTAAATGCAGTGATGGAGGGATTT
TATGAGAAAATGAGATCAGTGGGATTCAGAGAACCCGAAAGCAGTCCTACAGATGAAGTT
GAAGCTTCAAAAGCTGAGATTTTTTGTGGACACAGTGAGAGACTAGCAGTTGCATTTGGG
CTCATTAATACAGCTCCTGGGATGCCAATATGGGTGACTAAGAACCTTTACATGTGCCAA
AGCTGCCACAATACTATCAAATTTATCTCTAAGGTTGTGCGTCGGGAGATTTCTGTAAGA
GATACCGAAAAGTTTCACCATTTTAAGGATGGCTCCTGCACTTGTGGGGATGAAGGTTAC
TGGGGAAGCTCCAATAAATGA |
PEP |
MTVCSTSSISTQNPNSDLNELCRHGNLEKALKLLDSMQELQIKVEEDAYIALVRLCEWKR
THEEGARVYSYVSNSTTLLSVKLGNALLSMFVRFGNLVDAWYVFGRMGERDVFSWNVLVG
GYAKAGFFDEALNLYHRMLWVGIVPDVYTFPCVLRTCGAVPDLARGREIHVHVIRFGFES
DVDVVNALITMYVKCSAVGSARMLFDRMPRRDRISWNAMISGYFENGEFLEGLRLFLMML
ESSVYPDLMTMTSLISACELLGDCELGREIHGFVMRTEFAEDVSVCNALIQMYSIIGHFE
EAEKVFSRMEYKDVVSWTSMISCYGNNALPDKAVETYRMMEREGIMPDEITIASVLSACA
CLGNLDMGVKLHELAYRTGFISYVIVANTLIDMYSKCKCVDKALEVFHGIPGKNVISWTS
IILGLRINNRCFEALIFFRQMKLSLKPNSVTLVSVLSACARIGALMCGKEIHAHALRTGV
AFDGYLPNALLDMYVRCGRMGSAWNQFNYNKKDVAAWNILLTGYAQRGQGRHAVELFDRM
VESHADPDEITFISLLCACSRSGMVGEGLEYFRSMKLNYSITPNLKHYACVVDLLGCAGQ
LDDAHEFIQKMPINPDPAIWGALLNACMIHKQVELGELAAHQILKMDTESVGYYALICNL
YAQCGKWEEVAIVRKTMRKRGLTVDPGCSWVEVKGKVHAFLSGDNFHPQIKELNAVMEGF
YEKMRSVGFREPESSPTDEVEASKAEIFCGHSERLAVAFGLINTAPGMPIWVTKNLYMCQ
SCHNTIKFISKVVRREISVRDTEKFHHFKDGSCTCGDEGYWGSSNK |